Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q8VCE4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q8VCE4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8VCE4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8VCE4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms