Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rapgef3Q8VCC8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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Rapgef3Q8VCC8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rapgef3Q8VCC8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rapgef3Q8VCC8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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