Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Top1mtQ8R4U6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top1mtQ8R4U6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Top1mtQ8R4U6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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