Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rufy2Q8R4C2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rufy2Q8R4C2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy2Q8R4C2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy2Q8R4C2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy2Q8R4C2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy2Q8R4C2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy2Q8R4C2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy2Q8R4C2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy2Q8R4C2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms