Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3I3

Cog6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, mousemouse

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog6Q8R3I3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog6Q8R3I3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cog6Q8R3I3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cog6Q8R3I3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cog6Q8R3I3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms