Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3F9

Tut1, Speckle targeted PIP5K1A-regulated poly(A) polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tut1Q8R3F9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tut1Q8R3F9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tut1Q8R3F9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms