Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnaaf4Q8R368 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf4Q8R368 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnaaf4Q8R368 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms