Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc12Q8R344 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms