Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup58Q8R332 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup58Q8R332 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup58Q8R332 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup58Q8R332 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup58Q8R332 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup58Q8R332 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup58Q8R332 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup58Q8R332 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup58Q8R332 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup58Q8R332 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup58Q8R332 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup58Q8R332 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms