Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c5Q8R2T8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c5Q8R2T8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf3c5Q8R2T8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms