Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf183Q8QZS5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf183Q8QZS5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rnf183Q8QZS5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rnf183Q8QZS5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf183Q8QZS5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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