Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cdk5rap2Q8K389 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdk5rap2Q8K389 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk5rap2Q8K389 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms