Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ncapd2Q8K2Z4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ncapd2Q8K2Z4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms