Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stn1Q8K2X3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stn1Q8K2X3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stn1Q8K2X3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms