Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfip2Q8K221 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip2Q8K221 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip2Q8K221 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms