Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkd3Q8K1Y2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prkd3Q8K1Y2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkd3Q8K1Y2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms