Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sde2Q8K1J5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sde2Q8K1J5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms