Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-Q4Q8HWB2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-Q4Q8HWB2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms