Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc45Q8CIM1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc45Q8CIM1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms