Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CopaQ8CIE6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CopaQ8CIE6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms