Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGW4

Sox30, Transcription factor SOX-30, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox30Q8CGW4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox30Q8CGW4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox30Q8CGW4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox30Q8CGW4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms