Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rp1l1Q8CGM2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rp1l1Q8CGM2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp1l1Q8CGM2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp1l1Q8CGM2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms