Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brf1Q8CFK2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Brf1Q8CFK2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brf1Q8CFK2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Brf1Q8CFK2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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