Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx8Q8CFD4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx8Q8CFD4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snx8Q8CFD4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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