Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkl1Q8CEQ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms