Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc28aQ8CEI3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms