Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9030612E09RikQ8CE20 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms