Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc178Q8CDV0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc178Q8CDV0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc178Q8CDV0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc178Q8CDV0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms