Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phf20l1Q8CCJ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Phf20l1Q8CCJ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phf20l1Q8CCJ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms