Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Podxl2Q8CAE9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Podxl2Q8CAE9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Podxl2Q8CAE9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podxl2Q8CAE9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podxl2Q8CAE9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podxl2Q8CAE9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Podxl2Q8CAE9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Podxl2Q8CAE9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Podxl2Q8CAE9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Podxl2Q8CAE9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Podxl2Q8CAE9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms