Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430089I19RikQ8C9W1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A430089I19RikQ8C9W1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms