Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp20Q8C6M1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp20Q8C6M1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp20Q8C6M1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp20Q8C6M1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms