Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe22Q8C6A8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe22Q8C6A8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms