Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc113Q8C5T8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms