Protein–RNA interactions for Protein: Q8C267

Setdb2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb2Q8C267 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Setdb2Q8C267 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Setdb2Q8C267 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Setdb2Q8C267 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms