Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka5Q8C050 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka5Q8C050 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6ka5Q8C050 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms