Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod1Q8BVA4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lmod1Q8BVA4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod1Q8BVA4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod1Q8BVA4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms