Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nup54Q8BTS4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nup54Q8BTS4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup54Q8BTS4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms