Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cc2d1bQ8BRN9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cc2d1bQ8BRN9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cc2d1bQ8BRN9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms