Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR37

Nhlrc1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc1Q8BR37 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nhlrc1Q8BR37 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nhlrc1Q8BR37 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nhlrc1Q8BR37 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nhlrc1Q8BR37 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nhlrc1Q8BR37 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc1Q8BR37 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nhlrc1Q8BR37 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nhlrc1Q8BR37 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc1Q8BR37 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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