Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rab3gap2Q8BMG7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3gap2Q8BMG7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap2Q8BMG7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms