Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hirip3Q8BLH7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hirip3Q8BLH7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hirip3Q8BLH7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hirip3Q8BLH7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hirip3Q8BLH7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Hirip3Q8BLH7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hirip3Q8BLH7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms