Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc2Q8BKV1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc2Q8BKV1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc2Q8BKV1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms