Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tspan12Q8BKT6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tspan12Q8BKT6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan12Q8BKT6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan12Q8BKT6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan12Q8BKT6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan12Q8BKT6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan12Q8BKT6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan12Q8BKT6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan12Q8BKT6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan12Q8BKT6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan12Q8BKT6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms