Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan9Q8BJU2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan9Q8BJU2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan9Q8BJU2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan9Q8BJU2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan9Q8BJU2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan9Q8BJU2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan9Q8BJU2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan9Q8BJU2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan9Q8BJU2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan9Q8BJU2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan9Q8BJU2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan9Q8BJU2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms