Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prune1Q8BIW1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prune1Q8BIW1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prune1Q8BIW1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms