Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdca8Q8BHX3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdca8Q8BHX3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdca8Q8BHX3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms