Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GopcQ8BH60 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GopcQ8BH60 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GopcQ8BH60 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms