Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Best2Q8BGM5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Best2Q8BGM5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best2Q8BGM5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms