Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim6Q8BGE7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim6Q8BGE7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim6Q8BGE7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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